建筑行业三大体系认证是指：GB/T 50430工程建设施工组织质量管理体系认证、ISO 14001环境管理体系认证、ISO 45001职业健康安全管理体系认证。建筑行业三体系认证与普通三体系认证主要有以下不同：

1.认证内容：建筑行业三体系认证主要针对建筑行业的特定需求与质量管理、环境保护和职业健康有关标准的符合性。而普通三体系认证通常包括ISO 9001质量管理体系、ISO 14001环境管理体系和ISO 45001职业健康管理体系，适用于任何类型与规模的组织。

2.认证目的：建筑行业三体系认证主要是为了加强工程建设施工企业的质量管理工作，规范施工企业的工程投标、施工合同的签订、施工现场勘测、施工图纸设计等一系列流程，提高建筑施工企业管理水平。而普通三体系认证则是为了使公司生产和服务提供过程更规范化，提升企业的竞争力，具有通用性。

3.标准依据：建筑行业三体系认证与普通三体系认证都是基于国家相关产品质量法、标准法和计量法等法规和产品标准（包含国标、行标和企标）为依据，但建筑行业还有更多的特定标准和规定，如必须符合GB/T 50430的有关标准。

4.风险考量：由于建筑行业容易出现重大安全事故和隐患，住建部加强了对工程建设施工企业的质量监管，这也是建筑行业三体系认证特别关注质量管理的原因之一。

总体来说，建筑行业三体系认证与普通三体系认证在认证内容、目的、标准依据和风险考量方面有所不同，但都是为了提高组织的管理水平和竞争力。